选择合适的滤膜，关键在于它与所过滤液体（水性溶液、有机溶液或两性溶液）的化学相容性。尼龙膜和亲水PTFE膜，因其广泛的化学相容性，主要应用于HPLC相关的过滤，对水性溶液和有机溶液均可使用。亲水PVDF和PES膜，由于低蛋白吸附特性，主要用于蛋白质溶液的过滤，同时也适用于温和的有机溶剂过滤。而疏水PTFE膜，则因其广泛化学相容性，尤其适用于有机溶剂的过滤。MCE膜则专门用来处理水性溶液以及分析监测。
聚醚砜膜（PES）具有德国进口标准，其高亲水性能、高透明度及低蛋白吸附特点，使得它成为理想选择，对于进行除菌工作时对待的是含有较多微生物但为非离子性的物质而言，是一种非常好的选择。
聚四氟乙烯（PTFE）由于其绝对精度、高透光率、耐腐蚀性能以及宽范围内的化学稳定，它们被广泛应用在各种气体、酸碱类及其混合物及其他化合物中进行除菌与分离工作上。
聚偏二氟乙烯（PVDF）同样因为绝对精度高且拥有良好抗氧化性能，被用作了包括气体清洗、实验室设备中的管道系统清洁等多种场景。
尼龙纺织材料制成的一种特殊类型称为尼龙6/66，也是由带电荷功能单元组成，可以通过改变这些电荷功能单元来调整membrane表面的净化效果，因此可以应用在更复杂的情形下，比如对于某些特殊需要去除污染物的人工环境中。
聚丙烯塑料制作成的一种小孔网格结构，用以捕捉颗粒状污染物，如细菌或真菌孢子，并阻止它们进入更纯净环境，这使得这种材质非常受欢迎，在食品加工行业或者药品生产中做到最大程度减少细菌等微生物数量，从而保证产品质量安全。
混合纤维素作为一种亲水型薄壁式筛网，有着极佳清洁效能，可以快速有效地去除悬浮颗粒并保持流动通畅，是一个很好的解决方案，但仅限于那些不需要特别高纯度要求的情况下使用，如一般实验室操作中常见的小规模试验处置情况下的简单预处理任务，而不是精密分析研究阶段所需之级别严格需求条件下使用，因为那时可能会引起一定程度上的浸润现象降低效率甚至破坏样本自身属性，以此确保最终结果准确无误，避免任何可能性造成数据错误影响后续研究结果分析结论依据基础之上的信任价值失真情况发生，所以这并不代表所有测试都要采用这个方法，而是在说针对大部分简单实验案例来说这是一个足够安全且有效的手段工具选项。
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