选择合适的滤膜，关键在于它与所过滤液体（水性溶液、有机溶液或两性溶液）的化学相容性。尼龙膜和亲水PTFE膜因其广泛的化学相容性，主要应用于HPLC相关的过滤，对水性溶液和有机溶液都可进行过滤。亲水PVDF和PES膜由于低蛋白吸附特性，适用于蛋白质解决方案的过滤，并且可以处理温和的有机溶剂。疏水PTFE膜以其广泛化学相容性能优异，尤其适用于有机溶剂的过滤。而MCE膜则专门用来处理水性的流体以及分析监测。
聚醚砜(PES)滤芯采用德国进口材料，其高亲水特性、低蛋白吸附设计，使得绝对精度得到保证。这种类型最常见于用途是除菌过程中的水样流体处理。此外还有聚四氟乙烯(PTFE)滾丝，这种材料分为亲湿型及疏湿型，都拥有绝对精度且良好的化学稳定性能，不论是气态还是酸碱类及多种含有机物质的流体都能胜任。
聚偏二氟乙烯(PVDF)也分为两种：亲湿型及疏湿型，它们同样具备了绝对精度、高化学稳定性能，可应用于包括气态在内各种不同强度环境下的酸碱及含有机化合物的流体净化工作。
尼龙(N6N66)材质的一端带电荷，可以进一步细分成N6与N66两大类，其具有绝对精度，与之配套的是对于涂抹含有一定量共价键结合物或离子交换复合物等功能团队结构能够提供更佳清洁效果，以此实现从而达到更高纯净级别，同时亦可应用於各种各样的生物学研究中作为工具使用。
聚丙烯(PP)材质虽然不如上述几种材质表现出色，但仍然是一款被广泛认可并经常采用的产品，因为它在所有可能需要澄清、预筛选或去除颗粒杂质时显示出足够优秀地性能。在一些涉及到微观颗粒检测领域也有着不可忽视的地位。
最后，我们还不能忘记混合纖維素(MCE)、活性炭纖維(ACT)與玻璃纖維(GF)，它们分别擁有一定的親濕特質、去味/脱色能力以及去除小顆粒雜質作用力，這些属性使得這些類別之間存在著明顯差異，並為應用於不同的過濾情況提供了選擇依據。
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