选择合适的滤膜，关键在于它与液体（水性溶液、有机溶液或两性溶液）之间的化学相容性。尼龙膜和亲水PTFE膜因其广泛的化学相容性，主要应用于HPLC相关过滤，对水性溶液和有机溶液都可用。亲水PVDF和PES膜由于低蛋白吸附特性，主要用于蛋白质溶液过滤，同时也适用于温和有机溶液过滤。疏水PTFE膜则因其广泛化学相容性，更适合对抗有机溶剂的过滤。而MCE膜，则是专为处理水性溶液设计，用途包括分析监测。
聚醚砜（PES）滤芯采用德国进口材料，以高亲水、高精度著称，在处理含生物大分子物质时表现出色，并且具有低蛋白吸附能力。
聚四氟乙烯（PTFE）滤芯分为亲水型及疏水型，都具备绝对精度，其广泛的化学稳定性能使其能够胜任各种酸碱及有机化合物的除菌与净化工作。
聚偏二氟乙烯（PVDF）也是以绝对精度著称，它们同样拥有广泛的化学稳定性能，使得它们在气体净化以及各种强腐蚀性的介质中的应用无往不利。
尼龙膜作为一种带电荷类型，有N6及N66两种不同形式，其绝对精度使之在处理含污染物较多的情况下依然能提供清晰透明效果。
聚丙烯（PP）的使用范围更为宽泛，无论是澄清过滤、预过滤、颗粒杂质去除还是精密筛选，这些功能均由此材质完美实现，而混合纖维素（MCE）的親濕性能与低蛋白吸附特点，使得它成为理想选择来处理含生物大分子的清洁操作中所需的一系列步骤。
活 性炭纖維過濾器則擁有一定的反應活力，可以幫助去除氣味、顏色與其他雜質，這種過濾器通常被應用於對流體進行純化時的情況中。而玻璃纖維過濾器則適用於預過濾或去除固態顆粒等簡單篩選工作，因為這類過濾器具有較高耐用的特點，也便宜易得。
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