选择合适的滤膜，关键在于它与所过滤液体（水性溶液、有机溶液或两性溶液）的化学相容性。尼龙膜和亲水PTFE膜因其广泛的化学相容性，主要应用于HPLC相关的过滤，对水性溶液和有机溶液均可使用。亲水PVDF和PES膜由于低蛋白吸附特性，主要用于蛋白质溶液的过滤，也适用于温和有机溶剂的过滤。而疏水PTFE膜则以其广泛化学相容性而主打有机溶剂的过滤。MCE膜则主要针对水性解决方案进行过滤及分析监测。
聚醚砜（PES）型绝对精度高，德国进口材质，其亲水性能低蛋白吸附特点适用于除菌处理，如清洁各种含有的微生物污染物。
聚四氟乙烯（PTFE）型分为亲水与疏水两种，它们都具备绝对精度且具有良好的化学耐受能力，可用来去除气体中的杂质，并且能够抵抗强酸、碱及多种有机化合物。
聚偏二氟乙烯（PVDF）也存在親生與疏生兩種，而這些材料同樣擁有一定的絕對精度，並且能夠應對強酸、鹼以及各種類型的有機化合物過濾任務。
尼龍纖維（N6 N66）帶電荷效應，用於過濾含有人造色料或天然色素之產品，並能有效去除細小顆粒及微生物污染，這也是它在醫療領域中被廣泛採用的原因之一。
聚丙烯材料則是適合大多數流體澄清過濾，以及預過濾功能，可以處理包括固體颗粒杂质等在內的一系列操作需求，但通常不會達到絕對精度標準，因此較少用於高純淨要求的情況下進行選用。
混合纖維素薄膜由於其親 水性能與低蛋白吸附特點，使得它們成為了最常見的一種適用於日常實際運作中的滅菌過濾器選項，特別是在處理含大量血漿成分或其他蛋白質基質時非常適宜，因為這些薄膜可以保護感染來源並保持更安全環境，以防止傳播疾病感染路徑。此外，它們還能夠將雜散空氣中悬浮的小顆粒捕捉掉，這就意味著我們可以從任何一種未經處理透明介質中獲取淨化後無異味品質純粹之流體，只要我們使用的是玻璃纖維薄片。在這個情境下，我們不僅可以從未經過任何形式特殊調整或轉移前直接獲得出色的結果，而且我個人認為這是一個極大的優點，因為我發現很多人喜歡自己的生活方式保持簡單明了，不希望他們必須花費額外時間進行複雜程序或者購買專門設備來完成基本但重要工作。
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