化学物质污染
在现代社会，化学物质无处不在。工业废水、农药残留以及生活垃圾中含有的有机合成材料等，都会进入水体，使得原本清澈透明的河流和湖泊变得浑浊不堪。这些化学物质对人体健康构成了严重威胁，它们能够破坏生态平衡，影响生物多样性，还可能导致人类饮用源头水受到污染，从而引发各种健康问题。
物理污染
物理污染主要表现为沉淀物和浮游颗粒的增加，这些颗粉尘、泥土等都来自于地表侵蚀、建筑施工或者自然因素等多方面原因。当它们被带入水域时，不仅使得水色变暗，而且还会降低光照强度，对鱼类和其他海洋生物造成伤害。长期下来的沉淀也会导致河床升高，改变了原有的生态环境。
生物污染
生物污染是指由于过度养殖或非法倾倒宠物所致的动物尸体，以及病原微生物（如细菌、大肠杆菌）的排放。这类有机质在没有适当处理的情况下，很容易分解并释放出氮气与磷酸盐，使得水体中的营养元素超载，从而加剧eutrophication过程，最终形成藻 bloom，对整个生态系统造成巨大破坏。
水温变化
随着全球气候变化，一些地区出现了极端天气条件，如持续高温天气，这种情况下河流和湖泊的温度上升，也是对其正常生态状态的一种压力。在热季节，由于缺乏足够时间进行自我调节，冷却作用受阻，因此热量积累速度加快。如果没有适当的人工调控措施，就可能对淡水鱼类等敏感生物造成灭绝级别的危险。
填埋与土地侵蚀
城市扩张常常伴随着大量建筑工程，当这些建设活动完成后，其产生的地面碎屑及填埋垃圾往往被无序堆放在周边区域或直接倾倒到空旷的地方。风吹雨打之后，这些碎屑又逐渐渗透地下，最终进入地下层甚至滋养植被根系，而植物吸收后再次通过蒸腾排出，可以说是一个循环。但如果这部分碎屑及填埋材料未经处理便直接进入河道，那么它将成为新的沉淀源，不仅占据空间，还会减少底层溶氧，有助于发展腐败环境。
人口增长与基础设施建设需求增大
随着人口数量不断增长，同时伴随的是越来越多的人口需要使用到较好的住房、交通工具及其他生活设施。一系列基础设施项目，如道路修建、高楼兴起以及城市化进程推动之下，无意中也释放出了更多不可避免的地表径流。这一过程中包括但不限于洗车、喷洒草坪剂以及街道清洁工作产生的大量灰尘及化妆品残留，在雨季尤为显著，它们都会汇聚到排洪系统里最终进入河川或湖泊，加剧了已经存在的问题。
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