在选择过滤器时，我们需要考虑众多因素，以确保其既安全又经济，且能够有效地完成过滤任务。首先，我们需要明确过滤的目的，这可能是为了澄清、除菌、浓缩或分离物质。不同的目的要求不同的过滤类型和精度。
例如，如果我们的目的是除菌，我们通常会选择0.2μm或0.45μm的微滤网；而如果我们需要去除颗粒物，那么1~60μm的过滤网就更适合。而对于大分子分离，超滤网可以处理1000~300000 Dalton的大分子，而小分子则需要纳滤网来处理200~1000 Dalton的小分子。
除了这些，还有两个关键因素：一是选用合适的滤材，一是设计好的筛孔结构。在选择流体时，我们还需考虑流体的成分、PH值、化学性质以及温度等因素。这时候，可以参考化学相容性表来做出决定。如果是在液体中进行操作，亲水性材料如聚醚砜膜或尼龙膜通常更为理想；而对气体或者强酸碱溶媒进行操作时，则应该使用PTFE材料。
再者，还有一个重要的问题就是筛孔大小。在确定了流量和粘度后，这将帮助我们判断所需的最小筛孔尺寸。此外，由于液体粘度与流量成反比，因此对于具有较高粘度液体来说，所需筛孔尺寸将要增大。此外，在连续操作模式下，要至少增加10%以便应对不稳定的流量变化。
最后，不可忽视的是预过滤器是否必要。污染程度、高低颗粒分布以及前处理情况都将影响这一决定。如果预先实施适当的预过 滤步骤，可延长终端设备寿命并降低成本。常见的预过 滤器包括聚丙烯膜（SP型）。
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