地表污染物渗透问题
地下水污染的根源往往与地表环境有关，工业废水、农业化学肥料和农药等都可能直接或间接地进入土壤层，最终渗透至地下水层。这些有机溶剂、重金属和其他化学物质在土壤中积累，随着时间的推移会逐渐下沉，潜在地污染了深层的地下水。尤其是在缺乏有效监管和处理措施的地方，这种情况更为普遍。
城市建设扩张引发的问题
随着城市化进程的加快，越来越多的地块被开发成住宅区、商业设施等，这些活动不仅增加了建筑材料对土壤质量的影响，还通过排放及建筑工程中的泄漏等途径，对周边的地面及地下水造成了一定的压力。同时，由于施工过程中的交通流量增大，也增加了油气泄漏以及化学品滴落进入地面的可能性。
农业生产中使用过量肥料
为了提高作物产量，很多农民采用高浓度化肥进行施用，但这也导致大量无机氮和磷盐进入土壤，从而促使微生物活性提升，使得这些营养素转变为硝酸盐。这一过程虽然可以短期内促进作物生长，但硝酸盐容易流入地下水体，并且具有较强的氧化性，对鱼类甚至人类健康构成威胁。
工业废弃液体未妥善处置
许多企业在生产过程中产生大量废弃液体，如石油加工厂排出的石油残留物、制革厂排出的含铬废液等，如果这些废弃液体没有经过适当处理，而是直接倾倒或者堆存，就很容易渗透到浅层甚至深层岩石中，最终达到并污染了饮用 groundwater.
自然灾害带来的后果
自然灾害如洪涝时期，不仅会导致上游地区的一些垃圾填埋场或有毒废料库破坏，而且雨雪融化后的滞留在低洼区域的小溪河流也可能携带各种有害物质向下游移动，最终汇入河网系统，并进一步渗透至附近地区的地下水源。在这种情况下，即便是远离受灾区的人们，其饮用之下的地下水也难免受到一定程度的影响。
