选择合适的滤膜，关键在于其对液体（水性溶液、有机溶液或两性溶液）的化学兼容性。尼龙膜和亲水PTFE膜因其广泛的化学兼容性，主要用于HPLC相关过滤，对水性和有机溶液均适用。亲水PVDF和PES膜由于低蛋白吸附特性，主要应用于蛋白质溶液过滤，并能耐受温和的有机溶剂。疏水PTFE膜则因广泛的化学相容性，更适用于有机溶剂过滤。而MCE膜，以其处理水性解决方案及分析监测为主。
聚醚砜（PES）滤芯采用德国进口材料，为高亲水、高精度产品，特别适合对抗微生物污染的用途。在气体除菌方面，以及处理各种酸碱与强腐蚀性的有机溶剂时，可以选择聚四氟乙烯（PTFE）或聚偏二氟乙烯（PVDF）滤芯，这些都具备绝对精度，并且具有很好的化学稳定性能。
尼龙膜以带电荷为特点，又分N6、N66两种类型，其绝对精度也非常可靠，不仅可以处理纯净无菌操作，也是日常工业流程中的良好选择。当需要进行通用的澄清过滤、预过滤或者颗粒杂质筛选时，聚丙烯（PP）材质更是理想之选。而混合纤维素（MCE）的亲水性能使它成为除菌与净化中不可或缺的一部分。
活性炭纤维（ACF）的特殊作用力，使其在去味、脱色以及除去其他不需含物方面发挥巨大效用。而玻璃纤维（GF），作为一种基础型材，其功能在于初步排除固态颗粒，即便是在气体传输过程中同样有效。
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